毛囊炎的治疗方法包括自我护理和家庭方法，外用药以及在某些情况下的药物治疗。毛囊炎的发炎的毛囊可能会痒或刺痛。治疗既可以减轻症状，也可以治疗潜在的感染，消除皮肤上的红肿。
家庭治疗通常对轻度患者有效。每天用抗菌肥皂清洗患病区域，有助于保持该区域的清洁，还可以抵抗皮肤下引起红肿的细菌。用热敷方法在患处敷五到十分钟，可以帮助减轻瘙痒和疼痛。用14毫升醋对240毫升水特别有效。
外用抗菌药膏对轻度毛囊炎也有效。每天在该部位涂抹药膏，有助于杀死感染毛囊的细菌。含有聚维酮碘的药剂可以抵抗细菌并防止感染扩散。含有硒的洗发水可治疗头皮或胡须区域的毛囊炎。
对受毛囊炎影响的胡须区域进行剃须会进一步刺激毛囊并使病情恶化。如果必须剃胡，可以使用温水和肥皂或剃须膏对这些敏感区域进行轻轻按摩。每次在毛囊炎区域剃须时使用新的剃须刀，这有助于防止感染扩散或恶化。使用不含香料的乳液滋润皮肤，可以缓解毛囊炎并防止复发。
如果感染较深或较严重，或者不能在家治疗消除，你必须进行药物治疗。皮肤科医生可以诊断病情及原因，以确定最佳治疗方法消除感染。因细菌感染而患毛囊炎的患者可能需要服用口服抗生素。抗生素乳膏可以消除中度感染。由真菌感染引起的时，需要抗真菌药物。
使用外用或口服激素药物治疗毛囊炎，可以减轻肿胀和刺激感。皮质类固醇（激素）治疗通常只适用于对其他药物无反应的严重毛囊炎。患者要严格按照医生的建议使用这些药物。
