如果只有重现地球生命近40亿年的历史才叫“证明”，那穷尽人类文明也是不可能做到的；如果以可观测的证据证实生物演化的趋势，那现代科学早就已经给出了证明。
化石证据
化石是现代科学家了解十几万年以前生物的主要依据，因为现代技术最多只做到过在十数万年的化石中找到基因碎片。从地球生命历史来看，生物的种类最开始是比较少的，因为接近40亿年的生物化石很少，而地球历史上又经历过数次生命大灭绝和大爆发，大灭绝好说，是环境不适宜生物生存导致的，可大爆发是为什么？只能解释为是原有的生物种群中分化出了一部分进化为新的生物种类。一些人抛出的智慧创造论并不恰当，因为要创造那么复杂多样的生物种群，所需要消耗的物质和能量是难以预计的，超高级文明才不会有这个闲心，对它们来说遨游宇宙寻找新的可掠夺的能源才是最重要的。
分子学证据
基因是地球生物最根本的物质之一，控制着生物的性状和行为，并且会随着环境的变化产生一些可以遗传的变异，从而对整个种群的进化方向产生影响。人类和香蕉的基因相似度都有80%左右，和灵长类动物的相似度也在90%以上，和其他哺乳动物的相似度也有很多在85%以上。人类和其它动物的基因主要特征是大量的相似和少数的差异，而那些少数的差异就造就了地球生物的千奇百怪，也是那一点点基因差异使得人类产生了文明。而且在不同的生物体内可以找到相同的基因拷贝，人类体内也有8%的基因来自于逆转录病毒，形成内源性的逆转录基因。
在分子层面的证据还有蛋白质等物质的构造。地球多细胞生物都有细胞结构，而细胞的模式就原生生物界、原核生物界、真菌界、植物界和动物界几种，没一个生物门中，生物的细胞构造都是一致的，区别只是细胞表面物质的区别，而细胞表面或者行驶生命功能的蛋白，在结构上也会有大量的相似，仅仅有少数几个氨基酸的不同，造成蛋白空间构象的不同，而蛋白构造的差异又反映在基因层面。很难解释不同起源的生命共同选择以核酸构造基因，以氨基酸构造蛋白质。
胚胎发育
陆地生物拥有十分相似的胚胎发育规律，在受精卵早期的时候，蛙等两栖动物，兔子等哺乳动物和人类十分相似，胚胎的相似部位分化为新的器官和组织，在哺乳动物中，胚胎的各部分发育规律十分相似，只是不同动物胚胎发育的时间不大相同，最后的结果当然也有区别。对动物胚胎发育规律的研究，也可以用于间接研究人类胚胎的发育过程，在过去也获得了不少成功的案例。
生物技术证据
技术源于科学发现，现代生物学技术已经可以从生物的基因层面改变基因的表达，产生自然界原本不具有的生物，技术的实用性源于科学理论的正确性，很难以一个错误的开端搞出一个正确的技术，就像永动机一样，从科学理论上都是不可以实现的，至今也没有人搞出来。
地球生物是进化而来的证据非常多，只是由于知识传播的限制，还有很多人对进化论持怀疑态度，但是在生物学界，基本上已经没有科学家质疑，而且在主流的生物学杂志中，已经没有了直接怀疑整个进化论理论体系的文章发布，只有少数科学家因为个人发现，对以往进化论的某些方面有疑问。
