黑龙江中医药大学，位于黑龙江省哈尔滨市。是黑龙江省属重点大学。学校前身是1958年，由黑龙江省中医进修学校与牡丹江卫生学校合并成立黑龙江省中医学校。1959年黑龙江省中医学校、哈尔滨第一卫生学校、黑龙江省祖国医药研究所及黑龙江省立医院四个单位合并成立黑龙江中医药学院。1996年升级为黑龙江中医药大学。
哈尔滨医科大学，位于黑龙江省哈尔滨市。黑龙江省重点大学，省部共建高校。学校是1949年4月由原哈尔滨医科大学和原兴山（现鹤岗市）中国医科大学第一、二分校组建而成。2002年鸡西煤炭医学高等专科学校并入。
哈尔滨医科大学和黑龙江中医药大学虽然都是医学类高校，但是两所学校一家擅长中医药，一家擅长西医。恢复高考之后，因西医容易标准化流程化，使得西医取代中医成为大势所趋，在医疗卫生内部更是如此，这就使得中医药发展举步维艰，很难获得资金和项目支持。而同期的西医则有大批量的资金和课题支持。在这种大环境之下，整个西医院校都要比中医院校发展的更快一些，所以从规模上来看，哈尔滨医科大学明显要比黑龙江中医药大学的规模更大一些。但是两所学校在各自擅长的领域内来看，黑龙江中医药大学的影响力更大一些。毕竟黑龙江中医药大学在中药方面的研究绝对是世界级的，而且他是黑龙江省属院校中唯一的教育部指导委员会主任委员单位。
根据教育部第四轮学科评估结果来看，哈尔滨医科大学有1个A类学科，8个B类学科，其中最高评级为A-级的公共卫生与预防医学；黑龙江中医药大学有1个A类学科，3个B类学科，其中最高评级为A+级的中药学。两相对比，黑龙江中医药大学的学科质量更强一些。
综合来看，哈尔滨医科大学的实力要稍微强过黑龙江中医药大学！
