郑州大学是一所综合性大学，但是郑州大学上个世纪九十年代之前，尚未成名，后来逐步崛起，属于后起之秀；东南大学，也在走综合性大学路线，但是整体依旧严重偏向理工方向，属于老牌高校，上个世纪六十年代就列入了全国重点大学。
东南大学相对郑州大学优势在于理工科方面，除了水利工程等方面，几乎占据压倒性优势，这主要是因为东南大学前身是南京工学院，建校之初就是一所工科强校；而郑州大学组建之初，则是以文理为主的综合性大学，而且并没有获得名校资产，但是得到了名校援建，所以东南大学理工科强于郑州大学没有任何争议。
郑州大学，也并不是一无是处，毫无还手之力，其实郑州大学在医学方面，也占据着压倒性优势，团灭东南大学医学院。这主要是因为东南大学医学院来自原南京铁道医学院，而南京铁道医学院实力并不强，虽然前身是第五军医大学，不过第五军医大学主力已经调往西安，他属于剩下的留守人员组建的学校，实力真心太差。而郑州大学医学来自河南医科大学，属于老牌医学高校了。
郑州大学在人文社科方面也要领先于东南大学，毕竟郑州大学是文理出身的高校，虽然没有获得名校资源，也有近70年的积淀；而东南大学则是理工出身的高校，人文社科方面涉猎不深，所以实力略有不济也属于正常情况。总体来看，东南大学的实力强于郑州大学，但是并不等于说郑州大学毫无优势可言。
