近年来，祁连县农牧业紧紧围绕冷凉气候、环境和和资源优势，将农畜产品品牌建设作为转变农牧业发展方式，推动现代农牧业发展，调整农牧业产业结构、提高特色农牧产品市场竞争力，实现农牧业优质高效，引领带动传统农牧业转型升级的重要载体，全力提升特色农畜产品的自主创新能力，为打造高端产品，发展有机畜牧业奠定了基础。
一是以市场需求为导向，凭借资源优势，通过大力实施种子工程，培育出了祁连山牦牛、祁连藏系羊等名优畜种，并打造了祁连山牦牛、祁连藏羊名、优、特产品，区域布局合理、产业特色鲜明、产品质量优良、名牌优势突出的特色产业基地快速壮大。全县共建成县级选育中心2个，乡级选育基地5个，村级核心群571群，示范户优质畜存栏10.4万头只，淘汰杂色羊和欧拉羊4万只，全县杂色羊和欧拉羊存栏数由7.2万只下降至3.2万只，下降61%，牲畜生产性能大幅提高，全县牲畜良种化程度达85%以上。全县存栏量祁连山牦牛、祁连藏羊规模达到115.16万头只，年产毛1310吨，产肉12627吨、产奶6530吨，年出售牲畜规模达55万头只，商品率达46.9%；出栏幼畜规模达34.72万头只，其中：年鉴定输出优质种畜2850头只，已发展成为全州优质畜产品生产基地和种源输出基地，名优特农牧业产品品牌建设的基础奠定。
二是以新型农牧民经营主体培育、扶持、保护、壮大和农牧业产业化经营为纽带，有效促进了畜产品品牌创建的快速发展和农牧产业转型升级、提质增效。目前全县已培育和发展全国一村一品示范村2个，省级农牧业产业化龙头企业2家，州级龙头企业5家，注册登记农牧民专业合作社116家，家庭农牧场44家，种养大户85户。全县牛羊肉精深加工量达5000吨，占全县牛羊肉总产的38%，年加工“祁连山牦牛”牌酸奶720吨、鲜奶1440吨，占全县牛奶总产的18%。
三是以生产标准化、产品顾客导向化为主线，以发展“无公害、绿色、有机和地理标志”农畜产品（以下简称“三品一标”）为重点，发挥区域优势、特色优势，大力推进农牧业标准化生产、产业化经营、市场化运作，培育了一批具有较强影响力的区域性农畜产品品牌，促进了全县农牧业经济持续快速发展，申报登记注册农牧业商标 件，“祁连藏系”“祁连黄蘑菇”获国家地理标识，2个农牧业商标获青海省“著名商标”荣誉。祁连藏系羊肉（1300吨）、祁连藏系羊排（1000吨）、祁连藏牦牛肉（500吨）、祁连藏牦牛排（400吨）4件畜产品通过国家绿色食品标志认证。
