本周最新文献速递
一
文献题目：Genome-wide association study in almost 195,000 individuals identifies 50 previously unidentified genetic loci for eye color
不想看英文题目：全基因组关联研究鉴定50个新的眼睛颜色遗传基因座
杂志和影响因子：Sci Adv（13.116 1区 ）
研究意义：纳入10个人群的192,986名欧洲参与者，研究人眼颜色的遗传结构
结论：
1）鉴定了124个独立关联信号、61个基因座，其中50个是新发现的；
2）眼色基因座涉及黑色素沉着、虹膜形态和结构等过程；
3）进一步纳入1636例亚洲人进行分析，发现亚洲人的虹膜色素相关变异与欧洲人群相似，但其影响的效应值在亚洲人群中较小，频率也较低；
4）常见变异位点解释了眼睛颜色的53.2% ( 95% 置信区间： 45.4 - 61.0% )；
文章链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33692100/
DOI: 10.1126/sciadv.abd1239
二
文献题目：Asc-1 regulates white versus beige adipocyte fate in a subcutaneous stromal cell population
不想看英文题目：Asc-1调节皮下基质细胞群白色与米色脂肪细胞的命运
杂志和影响因子：Nat Commun（ 12.121 1区 ）
研究意义：了解小鼠青春期（2周龄）和成年期（8周龄）白色脂肪细胞（存储能量）、米色脂肪细胞（分解能量）和棕色脂肪细胞（分解能量）之间的相互转化
结论：
1）在小鼠青春期前脂肪细胞中发现了两大簇，其中一个富含Asc-1+细胞；
2）Asc-1敲除的小鼠，多个代谢表型发生变化，比如体重减少、肝脂肪变性、低血糖、体温降低等；
3）Asc-1功能缺失时，前脂肪细胞分化为米色脂肪细胞；
4）Asc-1过表达使得棕色脂肪细胞Ucp1表达减少；
5）抑制细胞亚群分化为米色脂肪细胞，需要前脂肪细胞ASC-1的转运活性；
6）Asc-1敲除，引起细胞内的D-丝氨酸积累，最终导致白色皮下前脂肪细胞分化；
文章链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33707431/
doi: 10.1038/s41467-021-21826-9
公开的资料：
GEO：GSE164350
三
文献题目：Identifying loci with different allele frequencies among cases of eight psychiatric disorders using CC-GWAS
不想看英文题目：使用CC-GWAS识别八种精神疾病中具有频率差异的等位基因型基因座
杂志和影响因子：Nat Genet（27.603 1区 ）
研究意义：很多疾病，比如双相情感障碍、精神分裂症、抑郁症等具有高度共享的遗传结构。通过CC-GWAS识别不同疾病中具有频率差异的等位基因型，鉴定新的基因座，为疾病之间的遗传差异提供新的生物学见解。
结论：
1）CC-GWAS可有效控制一型错误；
2）对八种精神疾病的GWAS summary数据进行CC-GWAS分析，鉴定了196个独立的基因座，且在重复数据集中能得到稳健的结果；
3）196个基因座中，有72个基因座在八种精神疾病的GWAS summary中没有达到全基因组显著阈值（5e-8），但通过CC-GWAS达到显著水平（这些位点称为CC-GWAS特异性基因座）；
4）在72个CC-GWAS特异性基因座中， 有2个基因座：KLF6 、 KLF16，主要与神经突生长和轴突再生有关。KLF6被报道过与SCZ相关联，而KLF16未被报道过，说明CC-GWAS可有效识别新的疾病基因；
文章链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33686288/
doi: 10.1038/s41588-021-00787-1
软件地址：
/wouterpeyrot/CCGWAS
