申请AEO认证的企业特别要注意以下几点：
第一、 先算财务指标再决定立项
有些公司领导在对海关AEO认证政策未理解的情况下仓促决定项目上马，这是非常不明智的选择。因为根据海关总署46号公告的要求需要企业达到海关规定的财务指标方可受理申请或者认证通过。
众所周知，受经济大环境的影响，不少企业的营业状况不及往年，而对度的审计报告往往要在的4-6月份才会做出，这时以审计报告的数据为准计算财务指标才是准确的。果子在AEO工作中经常见到一些企业的负责人在未出审计报告和未咨询财务部的情况下盲目自信，结果计算财务指标后才发现不达标，导致匆忙上马的AEO认证项目成了烂摊子。
当然，还有一些不负责任的辅导机构刻意回避财务指标的要求，在AEO认证辅导协议中明确财务状况不达标的免责条款，企业负责人不会觉得企业财务状况与辅导机构有直接关联就签署协议，直到海关因财务指标不达标而拒绝受理或者无法通过认证时才发现辅导机构赚了首付款后就不理不睬了。
第二、 申请目标谨慎定
不少企业，尤其是的生产型企业普遍想把申请AEO认证的目标定在AEO高级认证，殊不知不是每家企业都可以成为高级认证的。纵观全国的数据来看，海关AEO高级认证企业仅占海关注册企业的0.23%，但进出口额却占全国进出口总额的33.43%。这说明海关对AEO高级认证企业是有一定倾向性的。
通常来说，某家企业在行业中具有较大优势不足为其，在关区内的进出口额（报关单量）能挤进前1/3才会有更大的机会获得海关申请AEO高级认证的认可，反之则只能申请AEO一般认证，在满足一定规模的条件下再行申请AEO高级认证。
第三、 申请时机把握好
通常情况下，各关区普遍要在12月份进行内部工作总结，所以较少会受理新申请AEO认证。所以，
