解决方案

在使用R语言read.csv()函数读取csv文件时，会自动把TCGA样本中的-替换为.，为后续数据处理带来不便。

解决方法：在函数中添加check.names=FALSE

data <- read.csv("file.csv",check.names=FALSE)

具体解释

check.names是R语言read.csv()函数的逻辑参数，用于检查和修改数据框中的列名

默认情况下，check.names=TRUE，代表函数会自动检查和修改列名，确保它们符合R语言的命名规则

在R语言的命名规范中，是不包含-这一符号的，如果读取的CSV文件中包含了不符合R命名规则的列名，R语言会自动移除不合法字符，并用合法的字符代替。

例如，将空格替换为下划线，将点号替换为..等。