解决方案
在使用R语言read.csv()
函数读取csv文件时,会自动把TCGA样本中的-
替换为.
,为后续数据处理带来不便。
解决方法:在函数中添加check.names=FALSE
data <- read.csv("file.csv",check.names=FALSE)
具体解释
check.names
是R语言read.csv()
函数的逻辑参数,用于检查和修改数据框中的列名
默认情况下,check.names=TRUE
,代表函数会自动检查和修改列名,确保它们符合R语言的命名规则
在R语言的命名规范中,是不包含-
这一符号的,如果读取的CSV文件中包含了不符合R命名规则的列名,R语言会自动移除不合法字符,并用合法的字符代替。
例如,将空格替换为下划线,将点号替换为..
等。