区别就是根据企业规模及上市要求等不同，对上市公司进行分类，其股票在不同板块交易。
下面详细解释一下。
先从股票市场的产生说起。
最初，公司的初始投资者拥有公司的完全所有权，后来随着公司的经营，公司前景被看好，投资人想扩大经营，但是没钱。于是投资人便把公司改制为股份有限公司，就是把公司分成一份一份的，把公司按份出售，然后承诺等公司盈利了会根据大家买的份额来给大家分红，但凡看好公司的人，就可以用这种方式来投资，那初始投资者也可以用融到的钱来扩大经营，两全其美。
当然，你说公司前景一片美好，你把公司分成一份一份的卖，国家会让你随随便便这么干么？万一你是个大忽悠，不就是非法集资了么？
但是企业经营规模的扩大与资本需求的不足确实是个问题，所以后来才会有受国家监管的股票市场的诞生，企业可以以股票这种有价凭证向社会公开发行，以吸收和集中分散在社会上的资金，满足公司的融资需求，但是企业的这种行为要满足一定的条件，并且要受到监管。
1990上海证券交易所和深圳证券交易所先后成立，中国大陆只有这两个证券交易所，简称上证和深圳，而大家股民开户的证券公司，就是合法的股票买卖中介。
证券交易所是为咱们提供股票发行和流通的市场，而证券公司是作为股票交易的中介机构。
前面的明白了，接下来就好理解了。
大家上面有提到中国大陆只有两个证券交易所，上证和深圳，这两个交易市场将上市的股票划分为不同板块。
主板：像比较大、比较牛气的企业通常会选择在主板上市，有上海证券交易所主板（股票代码60开头）和深圳证券交易所主板（股票代码000开头）。
中小板：像企业稳定发展，但是却达不到主板挂牌要求的企业就会选择中小板上市，属于深圳证券交易所的一个板块（股票代码002开头）。
创业板：像企业有技术、有创新、企业业绩每年持续增长的企业，但是也达不到主板上市条件，这类企业通常会选择在创业板上市，属于深圳证券交易所的一个板块（股票代码300开头）
新三板：偶国继上海证券交易所和深圳证券交易所后又成立了一个全国性证券交易场所—全国中小企业股份转让系统（股票代码8开头）。
像一些中小企业，达不到主板、中小板、创业板的挂牌要求，就会选择在全国中小企业股份转让系统挂牌，新三板不是IPO。
至于说企业选择上市板块时的具体参考依据是什么？
详情请自行查询{上海证券交易所股票上市规则}{深圳证券交易所股票上市规则}{中小板IPO条件}{创业板IPO挑剔}{新三板挂牌条件}。
综上，主板、中小板、创业板、新三板不同的叫法就是对满足不同上市条件的公司的区分，源于中国建立的多层次的资本市场，满足不同企业的融资需求。
