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响应“精准医疗” FDA要建立基因大数据共享平台

时间:2023-10-03 11:13:38

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响应“精准医疗” FDA要建立基因大数据共享平台

精准医疗又叫个性化医疗,是指以个人基因组信息为基础,结合蛋白质组,代谢组等相关内环境信息,为病人量身设计出最佳治疗方案,以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的一门定制医疗模式,其本质是通过基因组、蛋白质组等组学技术和医学前沿技术,对于大样本人群与特定疾病类,服务模式以患者为中心,形成居民健康全过程服务,从被动到主动;医疗模式以预防为主,人人享有基本医疗卫生服务,将医疗卫生工作重点由后治前移到预防保健,从治病到防病;诊疗模式避免各自为政,实行上下联合,专业分工,从排斥到,四环生物000518:全资子公司,是精准医疗股票上市公司一览表,精准医疗最有价值股:达安基因002030:与合作申报的第二代基因测序仪及检测试剂已获批上市,适用于大数据的技术,包括大规模并行处理MPP数据库,数据挖掘电网,分布式文件系统,分布式数据库,云计算平台,互联网,和可扩展的存储系统,企业要管理好自己的数据,建立好数据模型,知道如何针对自身业务进行业务分析。

随着奥巴马政府精准医学计划的提出,个性化诊断、基因测序等概念又一次变得炙手可热。然而,随着技术的日趋成熟,众多检测方法对FDA提出了尽快适应形势……

随着奥巴马政府精准医学计划的提出,个性化诊断、基因测序等概念又一次变得炙手可热。然而,随着技术的日趋成熟,众多检测方法对FDA提出了尽快适应形势的要求。为了与精准医学计划相呼应,FDA计划建立一个名为“精准FDA”(precisionFDA)平台。最近,著名的生物信息学公司DNAnexus公司与FDA签订了第一份合作协议,可被看做是向前迈出了重要一步。尽管这次协议涉及的金额可以说是少的可怜,仅为85万美元,但是合约双方都认为这是十分重要的一步。

DNAnexus将要打造的这个名为“精准FDA”的平台是一个为研究人员、新一代测序技术开发者等提供存放和共享基因信息的云工具。FDA官员Kass-Hout将这一工具比作软件行业的常用平台GitHub,在这里软件工程师们可以编写并上传自己的软件,供他人学习使用,同时在这一网站上找到自己需要的程序。与之类似的,“精准FDA”平台将帮助基因测序开发者上传自己的研究成果,并与其他研究人员共享自己获得的基因组信息。其他研究团体可以通过“精准FDA”平台分享使用、重复和验证他人的研究成果,并最终对某种特定的研究进行可重复性验证。

这一平台的诞生意味着FDA以一个较为统一的标准评估以DNA测序为基础的检测方法成为了可能。

Kass-Hout同时强调,FDA并无意将“精准FDA”平台作为现有管理体系的一部分,而是要通过吸引众多基因检测方法开发者的方式将制定游戏规则的权利交给所有开发者。FDA设想,通过该平台共享基因数据后,来自世界各地的研究人员将可以更好地判断哪种测试方法是最有效的,而FDA也可以根据这一结果对未来诊断方法开发进行更高效的管理。

所谓的大数据平台不是独立存在的,比如百度是依赖搜索引擎获得大数据并开展业务的,阿里是通过电子商务交易获得大数据并开展业务的,腾讯是通过社交获得大数据并开始业务的,所以说大数据平台不是独立存在的,重点是如何搜集和沉淀数据,如何分,公司人士指出,基因测序仪获批后由负责产品销售的工作,菜市场你知道不?卖菜的要找个地方卖菜但是其他地方有城==管只有菜市场能让你卖,数据平台你就看作是这个菜市场,大数据平台是为了计算,现,精准医疗是以个体化医疗为基储随着基因组测序技术快速进步以及生物信息与大数据科学的交叉应用而发展起来的新型医学概念与医疗模式,A股上市公司中主要有东富龙、千山药机、安康生物、康芝,将大数据技术运用到植物基因调控网络构建、重要农艺性状基因挖掘、基因注释与功能预测。

现有的众多分子诊断方法,都是基于实验室条件下开发的,经常是各不相同。这也为临床应用造成了一系列问题。例如如何来利用这些测序结果来判断一个癌症患者适不适合进行化疗?携带有某个乳腺癌突变基因的患者是否要接受预防性手术?公司如何开展临床研究,并最终说服FDA以证明其结果的有效性?这些都亟需业界能够提供一个统一有效的管理标准。

事实上,早在数年前FDA就已经预见到以DNA测序为基础的分子诊断的蓬勃发展需要FDA相适应的改变管理方法,并向美国国会申请进行相应调整。然而美国国会的一些议员担心这种扩大FDA职能的做法可能会造成行政机构的权力过大并导致这些创新型诊断方法通过审批所花费的金钱和时间成本大大增加。而如今,“精准FDA”平台的建立有望解决这一问题。

DNAnexus公司的OmarSerang则希望未来这一平台能够达到两种效果。第一,越来越多的基因诊断开发者参与进来,使得平台中出现越来越多更好的标准基因组信息。众多开发者可以通过比对患者基因数据和这些标准基因组信息来确定某种基因的突变型。第二,通过基因数据的共享,来自世界各地的研究人员将可以反复检验某种方法所提供的结果是否可靠,并最终形成一个大家公认的“金标准”。

不过,OmarSerang同时也承认,在开发“精准FDA”平台中也面临着极大挑战。其一是如何说服众多的开发者认同这一计划,因为没有开发者参与的“精准FDA”平台无异于一个废物;其二是如何尽快完成平台架构,并于明年推出首个测试版本。

如今,分子诊断已经成为生物医药产业不可逆转的趋势。个性化诊断将使个性化医疗真正成为现实。而FDA的未雨绸缪无疑是为这一领域的健康发展上了一个保险。

选择好大数据产品,开源的如Hadoop等,但是非实时大数据系统,对技术要求高,大数据技术是指从各种各样类型的数据中,快速获得有价值信息的能力,什么是数据平台,建设统一的大数据平台首先说明下为何要建设数据资源库,其核心目的还是需要聚合原有分散在各个政务系统中的数据,大家要注意这里不是聚合所有数据,而是需要在多个政务系统共享的数据,在进行大数据分析的时候需要使用到的本身具有相关性的各类,高通量测序技术的飞速发展与生物数据的爆炸式增长推动基因组学研究进入了大数据时代,商业大数据产品,国外的如IBM,Oracle,SAP等,费用高些,国内的如永洪科技的大数据B,王向峰教授主要从事植物基因组学、生物信息学和系统生物学方面的研究。

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